基本信息:
姓名: 徐 丹
出生年月:1983.07 毕业院校: 第二军医大学
户籍: 上海市 学历: 博士
联系电话:18801784186 专业: 遗传学
个人简介:
徐丹,博士,助理研究员。研究领域为消化道肿瘤表观遗传学,主要从事肝再生、肝癌、肝干细胞和非编码RNA 调控研究,熟悉肝再生、肝癌、肝干细胞研究领域的前沿和动态,掌握肝再生、肝癌、肝干细胞及非编码RNA研究的各种技术和方法。迄今为止,在非编码RNA 调控肝再生、肝癌机制的相关研究领域,已经发表9 篇SCI 期刊论著,总影响因子80.571,主要论著发表在Hepatology、Carcinogenesis、Oncotarget及Biochim Biophys Acta 等期刊;其中,以第一作者身份在Hepatology 期刊(2013,2014,2018,IF=14.079)上发表论著3篇;在Oncotarget 期刊上发表论著1 篇。近五年来,已负责承担国家自然科学基金青年项目1 项:长链非编码RNA-NR037844 在肝癌转移过程中的功能及机制研究,国家自然科学基金面上项目1 项:RNA 去甲基化酶FTO 介导的lncRNA-m6A 修饰对肝癌细胞代谢重编程的调控作用及机制研究,上海市自然科学基金面上项目1 项:长链非编码RNA-NR027250 在肝癌转移过程中的功能及机制研究,上海市卫计委青年项目1 项:循环血液中长链非编码RNA在肝癌转移中的预测应用及其机制研究;此外,还获得2016 年度同济大学青年优秀人才培养项目。在lncRNA 调控肝再生及肝癌的相关研究领域中,本人多次参加全国及上海市相关研究领域的学术会议,做大会报告,发表会议论文,并获得优秀论文奖。
学习工作经历:
2002/09-2006/06,黑龙江大学,生命科学学院,本科/学士
2006/09-2009/06,黑龙江大学,生命科学学院,硕士研究生/硕士
2010/09-2013/06,第二军医大学,基础部医学遗传学教研室,博士研究生/博士
2013/07-2015/12,上海交通大学,医学院附属仁济医院上海市肿瘤研究所(癌基因及相关基因国家重点实验室),助理研究员
2016/01-至今,同济大学附属杨浦医院/转化医学中心,助理研究员
主持及参与课题情况:
1、国家自然基金面上项目,81874151,RNA 去甲基化酶FTO介导的lncRNA-m6A修饰对肝癌细胞代谢重编程的调控作用及机制研究,2019/01-2022/12,57万,在研,主持。
2、国家自然基金青年项目,81402325、长链非编码RNA-NR037844在肝癌转移过程中的功能及机制研究、2015/01-2017/12、23万元、结题、主持。
3、上海市卫计委青年项目,20184Y0241,循环血液中长链非编码RNA在肝癌转移中的预测应用及其机制研究,2019/01-2021/12,10万,在研,主持。
4、上海市自然科学基金项目,14ZR1439100、长链非编码RNA-NR027250在肝癌转移过程中的功能及机制研究、2014/10-2017/10、10万元、结题、主持。
5、国家自然基金面上项目,81171937、肝再生过程中LncRNA 激活肝干细胞与肝癌发生的机制、2012/01-2015/12、50万元、结题、参与。负责内容:主要负责关键LncRNA 的筛选和体内体外功能研究
6、国家自然基金面上项目,81272280、DNA甲基化介导的miR-106a-363表达激活及其促结肠癌发生的作用与机制研究、2013/01-2016/12、70万元、结题、参与。负责内容:主要负责靶基因筛选与功能验证
7、国家自然基金面上项目,81372240、胎肝特异性长链非编码RNA调控肝发育、肝干细胞分化和肝癌细胞上皮-间质转化的表观遗传学机制研究、2014/01-2017/12、75万元、结题、参与。负责内容:主要负责靶基因筛选与功能验证
8、国家自然基金面上项目,81874201,APC 通过泛素化调控凋亡的机制及其作为大肠癌化疗疗效标志物的研究,2019/01-2022/12,53万,在研,参加。
9、校级人才计划-同济大学青年优秀人才培养行动计划,2017/01-2018/12、5万、在研、主持。
10、院内课题,长链非编码RNA调控肝脏再生及肝癌复发转移的功能及机制研究、2016/04-2018/04、3万、结题、主持。
11、院内人才计划-晨光计划,2017/01-2019/12、4.7万、在研、主持。
参加学术会议:
2014 第八届中国肿瘤学术大会 济南 参加
2013 上海市医学会医学遗传学术年会 发表会议论文
2013 全国第十二次医学遗传学学术会议郑州 大会报告并获优秀论文奖
2012 全国第十一次医学遗传学学术会议武夷山 发表会议论文
2012 上海市医学会医学遗传学术年会 发表会议论文
代表性论文(#第一作者;*通讯作者)
1、期刊论文:
1. Dan Xu#, Fu Yang#, Ji-hang Yuan#, Ling Zhang, Hai-shan Bi, Chuan-chuan Zhou, Feng Liu, Fang Wang*, Shu-han Sun*. Long noncoding RNAs associated with liver regeneration 1 accelerates hepatocyte proliferation during liver regeneration by activating Wnt/β-Catenin signaling. Hepatology. Volume 58, Issue 2, Pages: 739–751, August 2013. (IF=14.079)
2. Jia De-shui#, Dong Rui#, Jing Ying#, Xu Dan#(co-first author), Wang Qi-feng, et al. Exome sequencing of hepatoblastoma reveals novel mutations and cancer genes in the Wnt pathway and ubiquitin ligase complex. Hepatology,Volume 60, Issue 5, pages 1686–1696, November 2014 (IF=14.079)
3. Dan Xu#, Ling Li#, Lin-sheng Wang, Xi Ma, Hong-meng Li,et al. Long noncoding RNA (lncRNA) down-regulated expression by HIF1α (DREH) inhibits hepatocellular carcinoma metastasis by silencing CDH2 expression. Accepted by Hepatologyon 10/31/2018. (IF=14.079)
4. Li Yan#, Xu Dan#(co-first author), Bao Chun-yang#, Zhang Yuan-nv, Chen Di, et al. MicroRNA-135b, a HSF1 target, promotes tumor invasion and metastasis by regulating RECK and EVI5 in hepatocellular carcinoma.Oncotarget, 6(4), 2421-2433, December 2014.(IF=5.168)
5. Fu Yang#, Ling Zhang#, Xi-song Huo, Ji-hang Yuan, Dan Xu, et al. Long noncoding RNA high expression in hepatocellular carcinoma facilitates tumor growth through enhancer of zeste homolog 2 in humans.Hepatology, 54(5):1679-1689, November 2011. (IF=14.079)
6. Ling Zhang#, Fu Yang#, Ji-hang Yuan#, Sheng-xian Yuan#, Wei-ping Zhou, Xi-song Huo,Dan Xu, et al. Epigenetic activation of the MiR-200 family contributes to H19-mediated metastasis suppression in hepatocellular carcinoma.Carcinogenesis2013 Mar;34(3):577-86 (IF=5.072)
7. Hai-shan Bi#, Xiang-yue Yang#, Ji-hang Yuan#, Fu Yang#, Dan Xu, et al. H19 inhibits RNA polymerase II-mediated transcription by disrupting the hnRNP U-actin complex. Biochim Biophys Acta, 1830(10):4899-4906, June 2013. (IF=3.679)
8. Hui-hong Jiang (#), Hua-guang Li (#), A-jian Li, Er-jiang Tang,Dan Xu, et al. Preoperative combined hemoglobin, albumin, lymphocyte and platelet levels predict survival in patients with locally advanced colorectal cancer. Oncotarget. 2016 Sep 27. doi: 10.18632/oncotarget. 12271. (IF=5.168)
9. Hui-hong Jiang (#), Er-jiang Tang, Dan Xu, Ying Chen, et al. Development and validation of nomograms for predicting survival in patients with non-metastatic colorectal cancer. Oncotarget. 2017 May 2;8(18):29857-29864. (IF=5.168)
10. Dan Xu, Da-wei Li, Chen-xi Zhao, Le-chen Li, Jun-jie Zhang, et al. ALKBH5-mediated m6A-Demethylation Activates lncRNA-MDAL Promotes Hepatocyte Proliferation and Glycometabolism by Pentose Phosphate Pathway. Under review by Science Translational Medicine. (Manuscript Number: aav1659)
2、会议论文:
1. Dan Xu, Fu Yang, Ji-hang Yuan, Ling Zhang, Hai-shan Bi, Chuan-chuan Zhou, Feng Liu, Fang Wang, Shu-han Sun*,Long Noncoding RNAs Associated With Liver Regeneration 1 Accelerates Hepatocyte Proliferation During Liver Regeneration by Activating Wnt/b-Catenin Signaling. 全国第十二次医学遗传学学术会议论文集,2013.4.18-21,郑州.大会报告并获优秀论文奖。
2. 徐丹,杨富,袁继行,毕海珊,张铃、周传传、刘峰、王芳、孙树汉*,LncRNA-LALR accelerates hepatocyte proliferation and cell cycle progression in liver regeneration by Wnt/β-Catenin signaling. 全国第十一次医学遗传学学术会议论文集,2012.10.28-31,318页,武夷山,2012年。
3. Fang Wang, Dan Xu, Fu Yang, Ling Zhang, Xisong Huo, Jihang Yuan, Haishan Bi, Chuanhuan Zhou, Chunqi Gu, Ruiwen Chen, Shuhan Sun*, H19 promotes proliferation and Epithelial-Mesenchymal transition through a myc-related feedback loop during liver regeneration in mouse.2012年上海市医学会医学遗传学术年会会议论文集,2012.06.16,103-104页,上海,2012年。